Новости

Российско-вьетнамский научный проект

Говорить интересно лучше,
чем говорить много.
Вьетнамская пословица

Предлагаем вашему вниманию рассказ о научном визите руководителя лаборатории МГММ Ш.З. Валидова и ведущего научного сотрудника Н.В. Трахтман в Социалистическую Республику Вьетнам, посвященный международному проекту

Научная поездка сотрудников лаборатории МГММ по проекту «Разработка биопрепаратов для фитобиоремедации почв, загрязненных диоксинами»

С 25 мая по 6 июня 2025 г. руководитель лаборатории МГММ ФИЦ КазНЦ РАН Ш.З. Валидов и ведущий научный сотрудник Н.В. Трахтман совершили научный визит в Социалистическую Республику Вьетнам (СРВ). Поездка в город Ханой проходила в рамках совместной работы с Российско-Вьетнамским Тропическим Центром.

Целью поездки являлся поиск долгосрочных биотехнологических решений для очистки почв СРВ от загрязнений диоксинами.

Научная программа заключалась в обсуждении и уточнении деталей проекта на совете Российско-Вьетнамского Тропического Центра. На заседании был представлен детальный проект лаборатории МГММ по устранению загрязнений диоксинов* в экосисемах. Сотрудники и приглашенные эксперты оценивали направления исследований и предлагаемые решения. Итогом совещания стало официальное одобрение проекта и программы его выполнения.

Участники переговоров пришли к взаимному соглашению, которое будет оформлено документально. Интересы всех участников были учтены и найдены точки соприкосновения. В целом совместная работа стала средством для налаживания сотрудничества и построения партнерских отношений. В результате этой встречи российская и вьетнамская стороны спланировали будущие действия и совместную работу.


История проблемы загрязнения диоксинами во Вьетнаме

Сотрудники лаборатории МГММ с вьетнамскими коллегами проводят совместные исследования по проблеме загрязнений диоксинами, обильно разлитых армией США в попытке принести «свободу и демократию» в эту Восточноазиатскую страну.

Идея американских «демократизаторов» была проста – высушить джунгли Вьетнама, а потом сжечь их напалмом вместе с скрывающимися там партизанами. Миллионы тонн «Ораньжа» распыляли по джунглям в надежде «выкурить» силы Сопротивления. За годы, прошедшие с Вьетнамской войны**, джунгли справились с распыленными диоксинами, практически полностью уничтожив их в своих экосистемах. Однако на военных аэродромах, где хранились диоксины, и местах захоронений огромного колличества бочек с этим пестицидом, которые американцы создавали около рек для долгосрочного вреда Вьетнаму, до сих пор показывают значительные уровни загрязнения.

Практически все население около мест заражения было отселено. Со временем эти территории стали вновь осваиваться. Следствием неустраненного и опасного загрязнения в этих местах стали массовые онкологические заболевания и рождение детей с аномалиями.

Вред диоксинов огромен! Места наиболее высоких концентраций до сих пор не заняты растительностью. Поэтому удаление этих загрязнений является важной задачей для Социалистической Республики Вьетнам.

Личные впечатления наших коллег

Первая поездка сотрудников лаборатории МГММ в СРВ состоялась в конце мая – начале июня 2025 г. Перелет Казань – Шанхай – Ханой оказался по логистике подходящим и удобным. За ночь благодаря Восточно-Китайским авиалиниям Ш.З. Валидов и Н.В. Трахтман были в Шанхае, где пересели на рейс тех же авиалиний до Ханоя.

На следующий день город Ханой встретил россиян влажным 35-градусным теплом и низкой облачностью. Тропический центр позаботился о трансфере из аэропорта до снятого жилья. И все остальные организационные моменты были безупречными: предоставленное жилье – удобным, каждое утро «вахтовый автобус» забирал всех на работу в 8:30 и отвозил обратно в 15:30 (правда, Шамиль Завдатович и Наталия Викторовна, работая в Тропическом Центре допоздна, ни разу не воспользовались этим сервисом в обратном направлении, а возвращались к месту проживания два километра пешком).

В выходные дни наши сотрудники посетили музей Хо Ши Мина (19.05.1890 – 02.09.1969), бывшего президента Вьетнама, видного революционного и политического деятеля. Для местного населения посещение музеев бесплатное.

Движение на улицах Ханоя достаточно хаотичное, очень много мотоциклов и мотороллеров. Пешеходные переходы абсолютно не означают, что пешеход главный – скорее это место, где он имеет право переходить дорогу. Впрочем, многие вьетнамцы переходят дорогу, где им удобно и больше нравится. Светофоры на улицах Ханоя, незначительно регулирующие движение, были введены только в предковидные времена. Следует отметить, что за все время пребывания в Ханое наши сотрудники не видели ни одного дорожно-транспортного происшествия. Вероятно, это связано с невысокой скоростью движения с взаимным уважением всех участников.

В целом необходимо отметить огромный и доброжелательный интерес вьетнамцев к России! До сих пор жива их память и благодарность поддержке, которую оказал Советский Союз во время Вьетнамской войны и после нее, когда страна находилась под жесточайшими эмбарго со стороны западных стран. Люди помнят и очень ценят добро!

Перспективы Российско-Вьетнамского сотрудничества

Устранение диоксинов и подобных хлор-ароматических соединений может иметь биотехнологическое решение. Микроорганизмы, деградирующие диоксины, снижают количество этих пестицидов и со временем могут свести их к предельно допустимому уровню или совершенно устранить.

Для этого российскими и вьетнамскими учеными планируется проведение комплексных исследований микрофлоры зараженных мест, выделения и характеристики наиболее активных микроорганизмов-деструкторов диоксинов. Итогом является создание биопрепаратов и способов удержания микроорганизмов, составляющих их основу, в почве для эффективного удаления загрязнений.

Экологический проект «Разработка биопрепаратов для фитобиоремедации почв, загрязненных диоксинами» будет выполняться лабораторией МГММ ФИЦ КазНЦ РАН и лабораторией микробиологии отдела биотехнологий Вьетнамской части совместного Российско-Вьетнамского Тропического центра в городе Ханой. Проект предполагает регулярные визиты сотрудников партнерских групп в города Ханой и Казань для проведения совместных экспериментов.


* Диоксины – полихлорированные дибензопарадиоксины и полихлорированные дибензофураны). Это обширная группа высокотоксичных органических соединений, являющихся стойкими загрязнителями, которые часто образуются как побочные продукты различных промышленных процессов и сжигания отходов. Они представляют собой твердые, бесцветные кристаллы с высокой температурой плавления и химически инертны. Диоксины являются одними из самых токсичных синтетических соединений. Накапливаясь в окружающей среде, включая воздух, воду и пищу, а также в жировых тканях живых организмов, они могут оказывать токсическое, мутагенное, канцерогенное и иммунодепрессантное действие.

Загрязнение диоксинами в Вьетнаме произошло в результате использования гербицидов и дефолиантов, содержащих диоксины, во время Вьетнамской войны. Особенно опасным оказался ТХДД, содержащийся в гербицидах «Агент Оранж» и «Агент Виолет», которые применялись для уничтожения лесов и растительности. ТХДД, попавший в окружающую среду, распространялся через почву, воду и воздух, загрязняя широкую территорию. Кроме использования гербицидов, американские войска также применяли массированные бомбардировки и тяжелую гусеничную технику для уничтожения растительности.

** Вьетнамская война (вьет. Chiến tranh Việt Nam, англ. Vietnam War) – вооруженный конфликт во Вьетнаме, Лаосе и Камбодже с 1 ноября 1955 г. до падения Сайгона 30 апреля 1975 г. Один из крупнейших локальных вооруженных конфликтов второй половины XX века. Это была вторая из Индокитайских войн, которая официально велась между Северным и Южным Вьетнамом. Северный Вьетнам поддерживали Советский Союз, Китай и другие коммунистические союзники; Южный Вьетнам – Соединенные Штаты и другие антикоммунистические союзники. Война длилась почти 20 лет, а прямое участие США закончилось в 1973 г. Конфликт также перекинулся на соседние государства, усугубив гражданскую войну в Лаосе и Камбодже, закончившуюся тем, что к 1975 г. все три страны присоединились к социалистическому лагерю. После того как конгресс США запретил войскам ООН и США поддерживать Юг, Южный Вьетнам был поглощен социалистическим Северным.

Война повлекла за собой огромные человеческие жертвы: оценки числа убитых вьетнамских солдат и мирных жителей колеблются от 966 тысяч до 3 миллионов человек; около 275 тысяч – 310 тысяч камбоджийцев, 20 тысяч – 62 тысяч лаосцев и 58220 военнослужащих США также погибли в ходе конфликта, а 1626 человек пропали без вести.

После окончания войны вновь возник советско-китайский раскол, и началась Третья Индокитайская война. Окончание войны во Вьетнаме вызвало появление вьетнамских лодочников и более крупный кризис беженцев в Индокитае, в результате которого миллионы беженцев покинули Индокитай, примерно 250 тысяч из которых погибли в море. Придя к власти, красные кхмеры осуществили геноцид в Камбодже, в то время как конфликт между ними и объединённым Вьетнамом начался почти сразу с серии пограничных рейдов, в конечном итоге переросших в камбоджийско-вьетнамскую войну, в результате которой правительство красных кхмеров было свергнуто в 1979 году. В ответ Китай вторгся во Вьетнам, и последующие пограничные конфликты продолжались до 1991 года. Коммунистический Вьетнам боролся с повстанцами во Вьетнаме, Лаосе и Камбодже. В США война породила то, что было названо вьетнамским синдромом, общественное отвращение к американским военным действиям за границей, что вместе с Уотергейтским скандалом способствовало кризису доверия, который затронул Америку на протяжении 1970-х годов.

 

Пущино, живи!

Пущино – это место, где можно заразить наукой.
Наталия Викторовна Трахтман

Предлагаем вашему вниманию научные выступления, впечатления и достижения молодых ученых лаборатории МГММ в г. Пущино

Девять сотрудников и студентов лаборатории МГММ приняли активное участие работе в 28-ой школе-конференции молодых ученых с международным участием «Биология – наука XXI века», прошедшей в г. Пущино 21-25 апреля 2025 г.

На секция «Молекулярная биология и биоинформатика» были представлены два очных – Агбоигба Элвис и Суханов Артемий – и три постерных – Некрасов Илья, Сулейманова Эльвира, Фукалова Анастасия – доклада. На секция «Микробиология и вирусология» выступили Кунгуров Галим и Валиахметов Эмиль, а также свои постерные доклады продемонстрировали Ложкарев Трофим и Яруллин Карим.

Помимо этого наши ребята и девушки приняли участие в мастер-классах по введению в ЯМР-метаболомику, докингу малых молекул к белкам, вестерн-блоттингу и подаче патента.

Работа конференции была насыщенной – научные доклады и круглые столы, мастер-классы и экскурсии, общение с коллегами, приехавшими из различных стран мира и городов нашей страны. Например, команда «Аннигиляторная пушка» (Агбоигба Э., Валиахметов Э., Кунгуров Г., Сулейманова Э. и Суханов А.) участвовала в традиционном Биоквизе, а совместная команда «Свиная потеха» (г. Казань Суханов А. и г. Пущино Кольжецов Н.) – в Фотоквизе.

Приводим впечатления наших участников о работе конференции, городе Пущино, новых знакомствах. Сначала послушаем молодых научных сотрудников лаборатории МГММ, имеющих опыт участия в различных конференциях и симпозиумах.

Агбоигба Элвис, м.н.с.: «Мне в Пущино понравилось – город, природа, общежитие – все прекрасно! Организаторы стараются, научные доклады на высоком уровне, много работ интересных и перспективных».

Валиахметов Эмиль, м.н.с.: «В Пущино я второй раз, город нравится, сама конференция тоже, она здесь по-особенному приятная, хорошо организована. Удивляет количество людей, многие из которых приезжают ежегодно. Институты – живые памятники, от стен веет мудростью и научной идеей. Приеду еще, чтобы поделиться новым и интересным. Пущино, живи!»

Кунгуров Галим, м.н.с.: «Поездка на конференцию «Биология – наука XXI века» оставила исключительно положительные впечатления. Мероприятие запомнилось не только хорошими докладами, но и предоставило отличную возможность для общения. Порадовали и прогулки по городу, и теплая атмосфера Биоквиза. Очень рекомендую эту конференцию как возможность получить опыт выступления на большую аудиторию!»

Суханов Артемий, м.н.с.: «Это мое далеко не первое посещение Пущино и второе участие в конференции «Биология – наука XXI века». Отличная конференция, с каждым годом лучше и лучше, побольше бы таких! Однозначно надо ехать в следующем году. Много общался с другими участниками, остались приятные впечатления. Отдельно отмечу коллег из г. Ростов-на-Дону, которые занимаются деградацией сульфонатов, опыт которых надо перенимать и в перспективе взаимодействовать».

Студенты также впечатлены поездкой.

Ложкарев Трофим: «В небольшом городе есть много мест, которые интересно посетить. Здесь много птиц, особенно галок. На конференции познакомился со многими молодыми учеными. Эти дни были очень насыщенными. Надеюсь приехать снова».

Некрасов Илья: «Организация конференции очень понравилась. Было интересно послушать научные доклады молодых ученых из секций «Молекулярная биология» и «Микробиология», беседовать с коллегами на различные темы. Сам город показался уютным со своей непередаваемой атмосферой, в которой сочетаются и наукоград, и особый темп жизни».

Сулейманова Эльвира: «Прекрасная конференция! Пущино – чудесный и уютный город. Очень понравилось, что организаторы помимо научной части, придумали для гостей различные мероприятия: экскурсии, игры и т.д. Запомнилась работа из Новосибирска про комбинированный метод ЭПР-спектроскопии с докингом для моделирования биомолекул».

Фукалова Анастасия: «Мне посчастливилось побывать в наукограде Пущино на конференции «Биология – наука XXI века», и впечатления остались самые положительные! Конференция была хорошо организована, я прослушала интересные доклады на секциях «Молекулярная биология и биоинформатика» и «Микробиология и вирусология», познакомилась с коллегами из разных городов. Особенно запомнился постерный доклад А.П. Роговой «Клонирование гена галактокиназы в составе мобилизаемого суицидального вектора PJQ200KS», связанный с темой моей дипломной работы. Очень понравился город с живописными видами и уютной атмосферой. В целом поездка получилась полезной, познавательной, приятной и дала заряд мотивации для дальнейшей работы».

Яруллин Карим: «Поездка понравилась очень сильно. Город спокойный и уютный. Во время конференции было много интересных научных докладов, встретился и пообщался со многими коллегами».

Особо отметим наших героев – Кунгурова Галима, доклад которого на секции признан лучшим по версии Микробиологического общества России, и Суханова Артемия, команда которого завоевала первое место на Пущинском Фотоквизе.

Все участники конференции – представители лаборатории МГММ – большие молодцы! Дальнейших вам творческих успехов!

Успехи молодого научного десанта

На 28 школе-конференции молодых ученых «Биология – наука XXI века» (г. Пущино, 21-25 апреля 2025 г.) приняли участие девять сотрудников и студентов лаборатории МГММ.

В работе секции «Молекулярная биология и биоинформатика» с докладами и презентациями выступили Агбоигба Элвис «Молекулярные механизмы гипузинирования у Candida albicans: выделение, мутационный анализ и функциональная характеристика дезоксигипузинсинтазы» и Суханов Артемий «Сравнение активности нативных и мутантных форм О-деметилаз семейства cyp255a по отношению к 4-алкилгваяколам и сиринголу». Постерные доклады представили Некрасов Илья «Клонирование и гетерологичная экспрессия галлатного оперона Pseudomonas putida KT2440 в клетках P. putida PCL1760»; Сулейманова Эльвира «Ген амилазы из метагенома горячих источников: клонирование, экспрессия и функциональный анализ» и Фукалова Анастасия «Влияние экспрессии гена rsfS на рост культуры агента биологической защиты Pseudomonas putida PCL1760».

На секции «Микробиология и вирусология» блестяще выступили Кунгуров Галим «Создание штамма Pseudomonas putida с уменьшенным образованием биопленки и сниженной подвижностью для применения в ферментации» и Валиахметов Эмиль «Уникальные нуклеотидные последовательности в геномах микроорганизмов для мониторинга штаммов». Были также постерные доклады Ложкарева Трофима «Выделение, биохимическая характеристика, антагонистическая активность и идентификация штаммов из образцов растения Orostachys spinosa, отобранных в прибайкальской лесной зоне» и Яруллина Карима «Штамм ризобактерии Bacillus velezensis MGMM30 в качестве потенциальной основы биопрепарата для защиты растений».

Мы гордимся нашими молодыми учеными!

От всей души поздравляем Галима Кунгурова, доклад которого на секции признан лучшим по версии Микробиологического общества России!

 

Рибосомные факторы Pseudomonas putida PCL1760

Младший научный сотрудник Айнур Камилевич Мифтахов выступил на лабораторном семинаре с докладом по теме будущей кандидатской диссертации «Факторы рибосом и их значимость для Pseudomonas putida PCL1760». Среди поставленных задач ключевое место занимает изучение механизма взаимной работы этих факторов, участвующих в адаптации исследуемой бактерии к неблагоприятным условиям среды.

В ходе доклада были представлены последние экспериментальные данные по изменению экспрессии рибосомных факторов при культивировании штамма P. putida PCL1760 в лабораторных условиях. Автором также проведена оценка влияния делеции рибосомных факторов на жизнеспособность клеток изучаемой бактерии при длительном хранении.

Рибосомные факторы
[Usachev K.S., Yusupov M. M., Validov S.Z. Hibernation as a stage of ribosome functioning //Biochemistry (Moscow). – 2020. – Т. 85. – С. 1434-1442.]

Представленные исследования направлены на понимание механизма регуляции синтетического аппарата, а также выживание бактериальной клетки в стрессовых условиях. Управление этим механизмом позволит изменять чувствительность бактерий к стрессу.

Инновационные подходы для восстановления нарушенных почв

Во всей Вселенной пахнет нефтью
Бертран Рассел

Ирина Александровна Дегтярева представила системный подход к восстановления нарушенных почв.

И.А. Дегтярева – главный научный сотрудник лаборатории МГММ, доктор биологических наук, лауреат Государственной премии Республики Татарстан в области науки и техники, специалист в области сельскохозяйственной микробиологии, агроэкологии, биоремедиации нарушенных экосистем.

Республика Татарстан является зоной добычи, переработки, транспортировки нефти, в результате этого происходят и аварийные прорывы трубопроводов. Поэтому актуальным для защиты окружающей среды, возвращения загрязненных территорий в активное землепользование и получения экологически безопасной продукции сельского хозяйства является применение природных штаммов с высокой эффективностью деструкции и другими многочисленными положительными свойствами.

Во время своего выступления Ирина Александровна рассказала о выделенных из природной среды – почвенной биоты Республики Татарстан – автохтонных штаммах, которые способны утилизировать широкий спектр углеводородов (вакуумный газойль, гексан, мазут, толуол, фенол) в концентрациях до 10-12%, синтезировать биосурфактанты, активно развиваться в среде с добавлением NaCl (до 6%) и др. Штаммы не генотоксичны, экологически безопасны, обеспечивают прогнозируемость результатов, их стоимость значительно ниже стоимости промышленных биопрепаратов. Эти штаммы проявляют высокую эффективность деструкции углеводородов при возделывании растений на черноземе до 73,1% и на серой лесной почве до 76,4%. Штаммы-деструкторы идентифицированы и депонированы в Ведомственных коллекциях Российской Федерации.

На платформе MiSeq Illumina проведено полногеномное секвенирование и аннотирование генома двух штаммов-деструкторов, подтвердившее наличие у них углеводородокисляющих свойств – выявлены гены, участвующие в биодеградации углеводородов.


Аннотирование генома штамма-деструктора углеводородов
Staphylococcus warneri S1*

На основе проведенных исследований получен патент РФ на изобретение № 2720199 «Штамм микроорганизмов Staphylococcus warneri S1 в качестве деструктора углеводородов, содержащихся в почвах, загрязненных нефтью и нефтепродуктами».

Таким образом, ФИЦ КазНЦ РАН обладает коллекцией микроорганизмов-деструкторов углеводородов, на которые получены справки о депонировании в ведомственных коллекциях РФ. Дополнительные фундаментальные исследования полногеномного секвенирования и аннотирования геномов остальных штаммов-деструкторов позволят Татарстану стать лидером по комплексному изучению почвенного микробного фонда в зонах техногенеза, пониманию действия механизма биодеградации нефти и нефтепродуктов автохтонными штаммами.

Завершая выступление, Ирина Александровна подчеркнула, что почва является базисом любой наземной экосистемы, от которой зависит здоровье нации. Для очистки и восстановления почвенных экосистем необходимо создание интегрированных технологических процессов на основе достижений фундаментальных, прикладных, междисциплинарных наук и практического опыта.

Сотрудники лаборатории МГММ приняли активное участие в обсуждении представленного доклада.

*[DOI: 10.15593/2224-9400/2021.1.01
Дегтярева И.А., Бабынин Э.В., Салаватуллина А.А. Изоляция, идентификация и полногеномный анализ углеводородокисляющего штамма Staphylococcus warneri // Вестник ПНИПУ. Химическая технология и биотехнология. – 2021. – № 1 – С. 5-13;
https://doi.org/10.32634/0869-8155-2024-380-3-104-108
Дегтярева И.А., Рахманова Г.Ф. Ускоренная технология очистки нефтезагрязненных почв / Аграрная наука, 2024. – №3 – С. 104-108.]

 

Итоги III Российского конгресса с международным участием по медицинской микробиологии и инфектологии

27-28 февраля 2025 года в Москве завершил работу III Российский конгресс с международным участием по медицинской микробиологии и инфектологии (РКММИ).

В мероприятии приняли участие свыше 200 лекторов-экспертов не только из Российской Федерации, но и Абхазии, Беларуси, Буркина-Фасо, Германии, Индии, Ирака, Казахстана, Китая, Португалии, Сербии. В течение двух дней конгресс и крупнейшую отраслевую выставку посетило 2100 специалистов.

В рамках пленарного заседания были представлены презентации журнала «Лабораторная диагностика. Восточная Европа» и Национального руководства «Медицинская микробиология. Клинически значимые микроорганизмы с позиции современной таксономии» – книги, вышедшей к открытию III РКММИ.

Во время работы конгресса особое внимание было уделено глобальной проблеме биологической безопасности. Эксперты сошлись во мнении, что в современных условиях прогнозирование биологических угроз, связанных с возникновением эпидемий и пандемий невозможно без развития искусственного интеллекта.

В рамках конгресса прошла III Всероссийская студенческая олимпиада по медицинской микробиологии им. З.В. Ермольевой. В отборочном этапе приняли участие более 500 студентов из 57 вузов, 42 городов и 5 стран. Одной из них была наша студентка 5-го курса КФУ ИФМиБ (медицинская биохимия) Анастасия Сухова.

В журнале «Лабораторная диагностика. Восточная Европа» в разделе «Экспериментальная и клеточная микробиология» опубликована статья старшего научного сотрудника лаборатории МГММ ФИЦ КазНЦ РАН, к.б.н. Н.М. Александровой и А.И. Суховой «Трансформация штаммов Pichia pastoris плазмидной ДНК и оптимизация условий экспрессии белка 388-391» (https://ammicrob.ru/upload/medialibrary/3c5/kq86mwg31e4e85lyw1p23wq9b95rdbip.pdf).

Конгресс стал ключевой площадкой для встречи членов профессионального сообществ – специалистов, объединенных общей идеей развития медицинской микробиологии.

Какой отец – такой и сын

Предлагаем вашему вниманию воспоминания о родине и научном становлении научного сотрудника лаборатории МГММ, кандидата биологических наук 
Керемли Сапармырадова

«Какой отец – такой и сын». Эта пословица – словно путеводная звезда пронизывает судьбу поколений, связывая их невидимой нитью. В этом контексте моя жизнь – яркое тому подтверждение.

Родившись 10 сентября 1993 года в солнечном Ашхабаде, я стал частью семьи, где знания и наука – не просто профессия, а образ жизни. Дед, Сапармурад Оразмурадович, был учителем биологии и с любовью передавал детям тайны природы. Отец, Аширмухаммет Сапармурадович, кандидат технических наук открывал двери в мир научных открытий. Мама, Сапаргуль Аннамурадовна – сердце нашего дома. Её забота и искреннее тепло создают атмосферу, в которой каждый чувствует себя любимым и защищённым. Она поддерживает нас в любых начинаниях, являясь не только матерью, но и верным другом, который всегда рядом с открытыми объятиями и добрым словом.

В 1993 году, когда я только начал делать свои первые шаги, отец возглавил опытную станцию Всесоюзного института растениеводства ВИР им. Н.И. Вавилова в городе Кара-кала. Это место стало настоящим раем, где среди изобилия фруктов, ягод, зелени я познавал мир.

С ранних лет был любознательным и стремился к знаниям. В 2000 году начал обучение в средней школе №1 города Кара-кала, а с 2005 года – в государственной школе-интернате для особо одаренных детей им. Сапармурата Туркменбаши.

Год 2010 стал знаковым: я не только получил аттестат о среднем образовании, но и завоевал квоту на обучение в ВУЗе за счет государства. Это была награда за труд и усердие, стремление к знаниям, которое впитал от родителей.

По государственной линии меня отправили в Российскую Федерацию, в славный город Казань, гордостью которой является Казанский государственный университет (в настоящее время Казанский федеральный университет), где особенно сильна биологическая школа. Именно на биолого-почвенном факультете КГУ им. В.И. Ленина в 2013 году я начал свой научный путь, погружаясь в мир биохимии под чутким руководством Фариды Кашифовны Алимовой. Годы учебы пролетели, наполненные дружбой и открытиями. Мои товарищи – А.З. Миндубаев, Р.И. Тухбатов, А.Н. Ибрагимов – стали не только коллегами, но и соратниками в стремлении к знаниям.

В 2015 году я получил диплом по специальности «биохимия». Поступив в аспирантуру, продолжил углубляться в науку. Защита диссертации по теме «Выделение и характеристика новых изолятов актинобактерий – продуцентов биологически активных веществ» в 2019 году стала кульминацией усилий и труда этого жизненного этапа. Мне присвоили ученую степень кандидата биологических наук по специальности «микробиология». Семейная традиция научного служения получила продолжение. Уверен, что у моего главного достояния – маленькой дочери Айпери – тяга к знаниям наследственная.


С отцом после защиты кандидатской диссертации 26 июня 2019 г.

С 2022 года я работаю научным сотрудником в лаборатории молекулярно-генетических и микробиологических методов ФИЦ КазНЦ РАН, где продолжаю развивать свои идеи и проекты под руководством Шамиля Завдатовича Валидова.

Путь, начатый моими дедом и отцом, продолжается!

Ферментация Pseudomonas putida в биореакторах

Отключение генетических систем у Pseudomonas putida PCL1760, отвечающих за фитнес штамма в ризосфере, улучшает ростовые характеристики в биореакторе. Снижение мобильности, угнетение биопленок делает геноредактированный штамм неконкурентным в природе.

[Frolov M., Kungurov G.A., Valiakhmetov E.E., Gogov, A.S., Trachtmann N.V., Validov S.Z. Construction of the Pseudomonas putida Strain with Low Motility and Reduced Biofilm Formation for Application in Fermentation. Fermentation, 2024, 10, 606. https://doi.org/10.3390/fermentation10120606].

Бактерии рода Pseudomonas относят к наиболее перспективным объектам биотехнологии. Помимо широкого распространения в окружающей среде штаммы псевдомонад могут обладать одним или несколькими полезными свойствами – способностью подавлять фитопатогены, положительно влиять на рост и развитие растений, а также индуцировать в них собственные механизмы защиты от различных неблагоприятных факторов.

Pseudomonas. putida, являясь безопасным хозяйственно-ценным биопродуктом, имеет и другие достоинства: широкий спектр потребляемых субстратов, надежные методы трансформации ДНК, большое количество секвенированных геномов.

В лаборатории МГММ ФИЦ КазНЦ РАН проводится разработка рекомбинантного штамма на основе Pseudomonas putida PCL1760 для биокаталитической трансформации ароматических производных лигнина. Установлена полная нуклеотидная последовательность штамма. P. putida PCL1760 – отличный кандидат для ферментации.

Новые знания о влиянии паразитического гриба Fusarium oxysporum на растения

Ученые трех научных центров – лаборатории молекулярно-генетических и микробиологических методов (МГММ) ФИЦ КазНЦ РАН, Института молекулярной биологии им. В.А. Энгельгарта РАН и Института общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН – исследовали, как организация генома паразитического гриба Fusarium oxysporum (Fox) связана со специфичностью к растению-хозяину. Впервые установлено, что более широкий круг растений-хозяев одного из изучаемых штаммов не может быть объяснен известными на сегодняшний день набором эффекторных белков.

[https://doi.org/10.3390/jof11020140
Ernest Nailevich Komissarov, Roderic Gilles Claret Diabankana, Inna Abdeeva, Daniel Mawuena Afordoanyi, Sergey Vladimirovich Gudkov, Ekaterina Mikhailovna Dvorianinova, Sergey Alexandrovich Bruskin, Alexey Alexandrovich Dmitriev and Shamil Zavdatovich Validov. Genomic Differences Between Two Fusarium oxysporum Formae Speciales Causing Root Rot in Cucumber // J. Fungi 2025, 11, 140].

Из миллиона описанных видов только 8000 являются фитопатогенными, однако эти микроорганизмы значительно и ощутимо снижают продуктивность современного мирового растениеводства. Fusarium oxysporum (Fox) является одним из распространенных фитопатогенных видов грибов, вызывающих заболевания растений в открытом грунте и теплицах. Особенностью этого микромицета является узкая специализация на растении-хозяине, а именно штаммы, патогенные к одному виду растений, за редким исключением не поражают неродственные виды растений. Огромное количество описанных форм F. oxysporum, поражающих сельскохозяйственные и декоративные культуры (гниение корней и сосудистое увядание), указывает на быструю эволюцию этих штаммов к паразитированию на новых видах растений.

Авторским коллективом трех ведущих научных центров изучены геномные различия между двумя формами Fox, чтобы понять, как они влияют на их специализацию к растению-хозяину. В работе сравнивали два штамма: Fusarium oxysporum f.sp. radicis-cucumerinum (Forc) V03-2g и Fusarium oxysporum f.sp.  radicis-lycopersici (Forl) ZUM2407. Первый выделен из инфицированных растений огурца, второй – из инфицированных растений томата.

Специфичность Fox к хозяину связана с эффекторными белками, известными как секретируемые в ксилеме (SIX). Эти гены связаны с неавтономным мобильным элементом миниатюрной импалы (mimp), обычно распределенным на дополнительных хромосомах. Паттерн mimp, связанный с эффекторными генами, использовался для прогнозирования профилей кандидатов-эффекторов, характерных для Fox formae speciales.


Оценка развития заболевания на двух сортах огурца, вызванная штаммами Forc V03-2g и Forl ZUM2407: красные стрелки – симптомы выпревания (А) и корневых гнилей (В)

В этом исследовании продемонстрирована патогенность штаммов Fusarium oxysporum f.sp. radicis—lycopersici (Forl) ZUM2407 и Fusarium oxysporum f.sp. radicis—cucumerinum (Forc) V03-2g в общем растении-хозяине (огурце) и проведено сравнение их геномов. В геноме Forl ZUM2407 отсутствуют шесть генов и их гомологов, в отличие от Forc V03-2g.


Диаграмма собранных геномов фитопатогенных штаммов Forl ZUM2407 (оранжевый) and Forc V03-2g (зеленый): (А) хромосомы (черные края обозначают наличие теломерных участков); (В) распределение генов на хромосмах; (С) распределение повторяющихся последовательностей; (D) распределение потенциальных эффекторных генов; (Е) серые линии представляют выравнивание гомологичных хромосом между двумя штаммами

Ученые показали, общее количество элементов mimp в геноме Forl ZUM2407 будет в три раза меньше, чем у Forc V03-2g (10 и 36 копий соответственно). Паттерн распределения mimp в Forl ZUM2407 полностью отличаеся от того, который присутствует в Forc V03-2g. Анализ профиля потенциального эффектора не предсказал, что Forl ZUM2407 способен инфицировать растения огурцов, как Forc V03-2g. Поэтому предполагается, что Forl ZUM2407 имеет другой тип организации генома, связанный с патогенностью, чем эффекторный профиль не может быть описан с использованием подхода на основе mimp.

Сотрудники лаборатории МГММ ФИЦ КазНЦ РАН убеждены, что эта теоретическая работа имеет значительный практический интерес, поскольку гены эффекторных белков, необходимых для патогенеза, являются идеальными маркерами для идентификации фитопатогенных штаммов на фоне большого количества почвенных безвредных штаммов рода Fusarium. Штаммы грибов-паразитов, которые очевидно содержат гены неизвестных ранее белков-эффекторов, могут быть благодарным объектом для получения новых маркеров фитопатогенности у грибов рода Fusarium.

12-я Международная научно-практическая конференция «Защита растений от вредных организмов»

12-я Международная научно-практическая конференция «Защита растений от вредных организмов» состоится 16-20 июня 2025 г. в Кубанском ГАУ по адресу: г. Краснодар, ул. Калинина, 13.

Организатор мероприятия – Российская академия наук, Министерство сельского хозяйства Российской Федерации, ФГБОУ ВО «Кубанский государственный аграрный университет имени И.Т. Трубилина», Министерство науки и высшего образования Российской Федерации, ФГБНУ «Всероссийский научно-исследовательский институт защиты растений», Федеральное государственное бюджетное научное учреждение, «Федеральный научный центр биологической защиты растений», Министерство сельского хозяйства и перерабатывающей промышленности Краснодарского края, Русское энтомологическое общество,ООО «Инновационный центр защиты растений».

Крайний срок подачи заявки по электронной почте – 30 апреля 2025 г., тезисов и справок об оригинальности материалов – 16 мая 2025 г.

Все подробности в прилагаемых документах.

1-е_информационное_сообщение_2025
ЗАЯВКА_Участника
ПРИМЕР ОФОРМЛЕНИЯ МАТЕРИАЛОВ
ТРЕБОВАНИЯ К ОФОРМЛЕНИЮ МАТЕРИАЛОВ