Выделение, идентификация и оценка полезных свойств микроорганизмов из ризосферы Orostachys spinosa

Современное сельское хозяйство сталкивается с проблемами, которые усиливают необходимость поиска экологически безопасных альтернатив химическим препаратам. Из ризосферы Orostachys spinosa (L.) выделены, идентифицированы и изучены 16 бактериальных изолятов, которые относятся к родам Pseudomonas, Bacillus, Curtobacterium. Штаммы могут быть использованы в сельском хозяйстве в качестве биоконтроля (р. Bacillus) или фитостимуляторов (р. Pseudomonas).

[https://doi.org/10.26907/2542-064X.2026.1.139-160
Суханов, А. Ю., Фролов, М., Некрасов, И. В., Ложкарев, Т. А., Валидов, Ш. З. (2026). Выделение, идентификация и оценка полезных свойств микроорганизмов из Orostachys spinosa (L.) лесной зоны Прибайкалья. Ученые записки Казанского университета. Серия Естественные науки. 2026, 168(1), 139-160].

Интенсификация возделывания культур приводит к истощению почвенного плодородия: постоянное использование азотных, фосфорных и калийных удобрений снижает биологическую активность микробиома, ухудшает структуру почвы и уменьшает ее способность удерживать влагу. Одновременно избыточное применение пестицидов вызывает накопление токсичных остатков, ухудшает качество воды и создает резистентность у патогенных организмов. В этих условиях биологический контроль, основанный на местных микробиологических симбионтах, представляет собой перспективный путь к устойчивому управлению агроэкосистемами.

Ризосфера растений, в частности суккулентного Orostachys spinosa (L.), является богатым источником бактерий, способных фиксировать атмосферный азот, мобилизовать нерастворимые фосфаты, синтезировать фитогормоны, например ауксины, и подавлять рост фитопатогенов. Выделение и детальная характеристика таких штаммов позволяет разработать биопрепараты, которые одновременно снижают потребность в минеральных удобрениях и уменьшают нагрузку химических фунгицидов.

Проведенное исследование по выделению, идентификации и анализу штаммов позволило обнаружить 16 бактериальных изолятов в ризосфере O. spinosa (L.), большинство из которых относятся к родам Pseudomonas и Bacillus, а отдельные представители – к роду Curtobacterium (рис. 1).


Рис. 1. Морфология колоний полученных бактериальных изолятов

При оценке антагонистической активности в отношении патогенных микромицетов рода Fusarium, способности продуцировать ауксины, а также выделять внеклеточные ферменты (целлюлазы и фитазы) отобраны перспективные штаммы – Bacillus sp. 117BA и 117BE, а также Pseudomonas sp. 117BB и 117BD (рис. 2).


Рис. 2. Антагонистическая активность бактериальных изолятов против
Fusarium sp. Fo2, Fusarium proliferatum Fo4, Fo8

Штаммы рода Bacillus показывают хорошую антагонистическую и ферментативную активность, а также способность усваивать атмосферный азот. Продукция ауксинов у них находится на среднем уровне среди всех штаммов. Для штаммов рода Pseudomonas антагонистическая активность не зафиксирована, но обнаружена фитазная активность и способность усваивать атмосферный азот. Уровень продукции ауксина аналогичен штаммам группы Bacillus (рис. 3).


Рис. 3. Средняя концентрация ауксина в среде после инкубации штаммов бактерий:
С – отрицательный контроль

Выделенные штаммы могут быть использованы в сельском хозяйстве в качестве биоконтроля (представители рода Bacillus) или фитостимуляторов (р. Pseudomonas). Их внедрение позволит сократить зависимость от химических удобрений и пестицидов, повысить урожайность сельскохозяйственных культур и укрепить их устойчивость к стрессам.

Российско-Вьетнамский научный проект Впечатления через расстояния

Объединение это начало, сохранение единства это прогресс,
а совместная работа это успех.
Генри Форд

Международный проект «Разработка биопрепаратов для фитобиоремедации почв, загрязненных диоксинами» между сотрудниками лаборатории МГММ ФИЦ КазНЦ РАН и учеными Российско-Вьетнамского Тропического Центра предполагает научные поездки в Социалистическую Республику Вьетнам.

Впечатления наших сотрудников, опубликованные на сайте лаборатории МГММ, вызвали большой интерес принимающей стороны.

Теперь на основе этих рассказов о научном сотрудничестве создана страничка на сайте Российско-Вьетнамского Тропического Центра, которую можно увидеть по ссылке https://trungtamnhietdoivietnga.com.vn/hop-tac-khoa-hoc-viet-nga-chung-tay-vi-moi-truong-va-phat-trien-ben-vung

Биотехнологический потенциал и метаболическое разнообразие лигниноразлагающих бактерий из древесины липы

Ежегодно в мире образуется около 50 млн т лигнинсодержащих отходов, однако промышленные биотехнологии их переработки до сих пор не созданы из-за нестабильности грибных ферментов. В данном исследовании коллективом лаборатории МГММ ФИЦ КазНЦ РАН впервые системно охарактеризовано бактериальное сообщество, разлагающее древесину липы (Tilia cordata), что позволяет выявить ранее неизученный резервуар генов и метаболических стратегий для эффективной деградации этого сложного полимера.

[https://doi.org/10.3390/microorganisms14020266

Shulga E.Y., Islamov B.R., Sukhanov A.Y., Frolov M., Laikov A.V., Trachtmann N.V., Validov S.Z. Biotechnological Potential and Metabolic Diversity of Lignin-Degrading Bacteria from Decaying Tilia cordata Wood. Microorganisms, 2026, 14(2), 266].

Лигносульфонаты представляют собой побочные продукты после обработки целлюлозно-бумажной промышленности. Важной проблемой является вторичное использование образующихся при этом отходов.

В опубликованной работе коллективом авторов лаборатории МГММ ФИЦ КазНЦ РАН представлен систематический анализ бактериального сообщества, ассоциированного с завершающей стадией разложения древесины липы (Tilia cordata). Результаты убедительно показывают, что поздние этапы деструкции древесины представляют собой уникальную экологическую нишу, где доминируют классические лигнинолитические актинобактерии, а также сбалансированный консорциум из родов Bacillus, Pseudomonas и энтеробактерий. С помощью метагеномного секвенирования выявлено исключительно высокое альфа-разнообразие (индекс Шеннона 5.07), что указывает на зрелое сообщество с узкой метаболической специализацией.

Сильной стороной исследования является комплексный подход: выделение 16-ти чистых культур на среде с лигнином как единственным источником углерода, их последующая таксономическая идентификация и глубокая функциональная характеристика. Бактериальные изоляты обладают пероксидазной/лакказной активностью и реализуют принципиально различные экологические стратегии.

С помощью динамического светорассеяния и высокоэффективной жидкостной хроматографии авторы классифицированы штаммы на «полных минерализаторов», «частичных метаболизаторов» и «накопителей интермедиатов», что является важным шагом к пониманию синтропных взаимодействий в природных микробных сообществах. Особого внимания заслуживают штаммы, эффективно деполимеризующие лигносульфонат, а также уникальный изолят Bacillus altitudinis MGMM812, обладающий максимальной пероксидазной активностью, но узкой специализацией к сирингату.

Практическая значимость работы заключается в создании репрезентативной коллекции штаммов, которые могут служить донорами генетических систем для конструирования синтетических консорциумов и биокатализаторов направленного действия.

Полученные результаты свидетельствуют, что эволюционно сложившиеся «блоки» метаболических путей у разных таксонов могут быть использованы для разработки промышленных процессов переработки лигнинсодержащих отходов.


Видовое разнообразие микроорганизмов, полученных из разлагающейся древесины, и определение лигниноразлагающих бактерий

И снова в любимом Пущино

В науке нет другого способа приобретения, как в
поте лица! Ни порывы, ни фантазии, ни стремления
всем сердцем не заменяют труда.
А. И. Герцен

С 20 октября по 4 ноября 2025 г. двое сотрудников лаборатории МГММ прошли стажировку в рамках проведения совместных работ по проекту Государственного задания «Адаптация метаболических путей деградации ароматических соединений с целью получения катехолов и цис-муконовой кислоты из лигнина» в институте биохимии и физиологии микроорганизмов им. Г.К. Скрябина РАН (г. Пущино).

Младшие научные сотрудники лаборатории Элвис Агбоигба и Эмиль Валиахметов вернулись окрыленными из г. Пущино, где прошли двухнедельную стажировку.

Основная цель поездки – углубление практических знаний в области энзимологии и тонкостей измерения кинетических констант ферментов.

Несмотря на короткий срок, стажировка оказалась очень продуктивной. Элвис и Эмиль получили не только ценные практические навыки, но и освоили тонкости экспериментальной работы с ферментами. Под руководством опытных наставников из лаборатории энзиматической деградации органических соединений был проведен полный цикл кинетического эксперимента: от приготовления буферных растворов и серийных разведений субстрата до работы на спектрофотометре и обработки полученных данных.

Общее впечатление от поездки в г. Пущино очень хорошее! Это новые навыки, знакомства, впечатления… И огромная благодарность коллегам за их открытость, терпение и готовность делиться своими знаниями.

Экология промышленных городов

Наука открывает тем, кто ей служит, грандиозные перспективы.
Ф. Жолио-Кюри

С 5 по 7 ноября 2025 г. на базе Федерального государственного бюджетного учреждения науки «Федеральный исследовательский центр «Казанский научный центр Российской академии наук» (ФИЦ КазНЦ РАН) успешно прошла Всероссийская научно-практическая конференция «Экология промышленных городов».

С приветственным словом выступили академик О.Г. Синяшин, заместитель министра экологии Республики Татарстан О.В. Мандичева, директор ИНХС РАН академик Ф.Л. Максимов, представители компании Сибур, заместитель директора по научной деятельности С.А. Зиганшина.

Организаторы конференции – Министерство образования и науки Российской Федерации, РАН, Научный совет РАН по глобальным экологическим проблемам, Министерство экологии Республики Татарстан (РТ), Академия наук РТ, ФИЦ КазНЦ РАН, Консорциум «Экология промышленных городов», РХО им. Д.И. Менделеева, журнал «Экологическая Химия», Ассоциация развития экомониторинга (АРЭМ).

Основные направления конференции:

  • аналитический мониторинг окружающей среды;
  • очистка воздуха, утилизация газовых выбросов, в том числе декарбонизация;
  • очистка природных и сточных вод;
  • утилизация твердых отходов и очистка почв;
  • получение полезных продуктов путем переработки отходов;
  • микропластик в окружающей среде.

На конференции были представлены пленарные, секционные и заочные доклады.

В работе конференции приняли участие сотрудники лаборатории МГММ ФИЦ КазНЦ РАН Ш.З. Валидов, И.А. Дегтярева, Э.В. Бабынин.

Сообщение главного научного сотрудника И.А. Дегтяревой «Перспективный природный штамм для рекультивации нефтезагряненных почв» о коллекции эффективных автохтонных штаммов-деструкторов углеводородов представлено на секции 4 «Утилизация твердых отходов и очистка почв».

На секции 6 «Микропластик в окружающей среде», где председателем был Ш.З. Валидов и обсуждались проблемы микро- и нанопластика, были интересные выступления:

1) Шевченко Н.Н. Адсорбция люминофора на модельных частицах микропластика и природных микрочастицах (Новгородский государственный университет им. Ярослава Мудрого, Центр исследования проблем микропластика);

2) Проскурнин М.А. Взгляд химиков на красный список химических веществ, вызывающих обеспокоенность в пластике (Московский государственный университет, химический факультет);

3) Проскурнина Е.В. Цито- и генотоксичность нанопластика по отношению к клеткам человека (Институт общей и неорганической химии им. Н.С. Курнакова РАН).

Согласно мнению докладчиков тема микро- и нанопластиковых загрязнений является сильно раздутой, поскольку ни тот, ни другой сами по себе не представляют опасности. Реальную угрозу представляют загрязнения, которые присутствуют в почве и водах, а вот они могут сорбироваться в частицы пластика.

Во время работы конференции во многих выступлениях отмечалось, что глобальным вызовом для человечества является обеспечение безопасного и устойчивого развития нашей цивилизации. Антропогенные нагрузки на окружающую среду возросли до масштабов, создающих риски для жизни и здоровья населения, проживающих в мегаполисах, поскольку стремительно растущие темпы урбанизации связаны с размещением предприятий в жилых микрорайонах, формированием гигантского парка производственного, общественного и личного транспорта.

В XXI веке уже 75% населения России проживает в городах, при этом имеет место тенденция к ухудшению экологической обстановки за счет производственных выбросов и отходов, которые изменяют состав окружающей среды и оказывают негативное воздействие на биосферу.

Все промышленные города имеют одинаковые проблемы: загрязнение атмосферного воздуха и водных ресурсов, формирование полигонов твердых бытовых отходов, образование которых ежегодно увеличивается, что создает еще одну проблему – грамотное обращение с отходами, включая их утилизацию.

В связи с этим от научного сообщества требуется поиск новых подходов к решению экологических проблем, которые обеспечат долгосрочное благополучие среды обитания для населения крупных промышленных городов.

Стратегия исследования биотехнологического потенциала микроорганизмов

                                               Каждый великий успех науки имеет своим истоком великую дерзость воображения.

Д. Дьюи

21 октября 2025 г. в здании Министерства науки и высшего образования Российской Федерации (РФ) под председательством заместителя министра Министерства науки и высшего образования Российской Федерации Д.В. Пышного состоялась отчетная конференция по представлению результатов реализации исследовательских программ, в рамках поддержки отдельных мероприятий Федеральной научно-технической программы развития генетических технологий на 2019-2030 гг.

В связи с этим выступили с докладами восемь руководителей исследовательских программ о ходе их реализации в 2025 году.

Заведующий лабораторией молекулярно-генетических и микробиологических методов (МГММ), Шамиль Завдатович Валидов представил презентацию по проекту «Генетические технологии для промышленной микробиологии и зеленой химии: экспрессионные платформы, продуценты ферментов и промышленно важных соединений» (Соглашение № 075-15-2025-471 от 29 мая 2025 г.).

В представленной нашим руководителем работе отражены цель и задачи проекта, отмечены ожидаемые риски при реализации исследований, подчеркнута степень участия и роль индустриального партнера в их реализации.

Целью проекта является создание технологической системы (конвейера) для выявления, клонирования, экспрессии структурных генов промышленно важных ферментов из метагеномных последовательностей и отдельных штаммов с целью получения штаммов-продуцентов.

Имея обширную коллекцию выделенных микроорганизмов из почв Российской Федерации (Татарстана, Башкирии и др.), Социалистической Республики Вьетнам, а также осадочных отложений горячих источников Камчатки и сточных вод, донных отложений сероводородных водоемов проводится их скрининг на изучение роста в экстремальных условиях.

 075-15-2025-471 Валидов (презентация)

Российско-Вьетнамский научный проект (октябрьские впечатления)

Знаешь – говори, а не знаешь – послушай других.
Вьетнамская поговорка

Предлагаем вашему вниманию заметки младшего научного сотрудника лаборатории МГММ, аспиранта А.Ю. Суханова о поездке во Вьетнам

С 12 по 25 октября 2025 года сотрудники лаборатории МГММ вновь отправились в город Ханой Социалистической Республики Вьетнам, чтобы продолжить плодотворное сотрудничество с нашими вьетнамскими коллегами из Российско-Вьетнамского Тропического центра по проекту «Разработка биопрепаратов для фитобиоремедации почв, загрязненных диоксинами».

Подобные поездки – не просто командировки, а важнейшая часть большого, сложного, совместного научного процесса. В этот раз во Вьетнам отправились: заведующий лабораторией МГММ Шамиль Завдатович Валидов, младшие научные сотрудники Эрнест Комиссаров и Артемий Суханов, лаборант-исследователь Михаил Фролов.

Цель и задачи поездки

Поездка оказалась крайне насыщенной и преследовала несколько ключевых целей. Главным являлось стратегическое планирование – совместно с вьетнамскими партнерами мы обсудили и наметили Дорожную карту исследований на 2026 год. Параллельно проводили эксперименты по колонизации растений специально подобранными штаммами микроорганизмов и углублённо анализировали результаты секвенирования геномов и метагеномов образцов почвы, загрязнённой диоксинами.

Научная работа в деталях

Каждый член нашей команды внёс весомый вклад в общее дело.

Эрнест Комиссаров с головой погрузился в работу с растениями. В лабораторных условиях он провёл серию экспериментов по колонизации растений томата и пшеницы штаммами бактерий, которые были ранее выделены из загрязнённой диоксинами почвы. Это кропотливая работа, требующая внимания к мельчайшим деталям. В результате Эрнесту удалось не только провести все запланированные опыты, но и выявить несколько наиболее перспективных штаммов. Именно они станут основными кандидатами для следующих этапов работы – тестирования на аутентичных вьетнамских растениях, которые в будущем могут быть использованы для рекультивации загрязненных земель.

Артемий Суханов взял на себя одну из самых современных и сложных задач – биоинформатический анализ. Он провёл для вьетнамских коллег настоящий мастер-класс, демонстрируя методы обработки огромных массивов геномных и метагеномных данных. Под его руководством проведено сравнительное исследование, которое позволило увидеть разницу между таксономическим составом и функциональными возможностями микробных сообществ в чистой и загрязнённой почве. Подобные данные – это ключ к пониманию того, как микроорганизмы реагируют на токсичное воздействие и как можно усилить их природную способность к очистке.

Роль Михаила Фролова в этой поездке следует отметить особо. Помимо своей исследовательской работы, он стал главным связующим звеном между российской стороной, нашими командированными сотрудниками и вьетнамскими партнёрами. Михаил обеспечивал безупречную координацию всех процессов, решая научные и организационные вопросы. Он блестяще справился с миссией по поддержанию морального духа команды, организовав культурно-досуговую программу, которая позволила нам немного отвлечься от работы и лучше узнать страну.

Не только пробирки, но и личные впечатления

Когда рабочий день заканчивается, начинается время для знакомства со страной, и здесь впечатления бывают самыми разными.

Шамиль Завдатович, наш заведующий, уже опытный «вьетнамовед». Своими наблюдениями о жизни и работе в этой стране он поделился в рассказе о предыдущей поездке, и его взгляд во многом остаётся актуальным. А вот младшие сотрудники лаборатории после двух недель в Ханое сошлись во мнении, что жизнь в джунглях – не совсем для русского человека. Непривычная, хоть и вкусная еда с обилием специй и трав; хаотичное и плотное дорожное движение, где главное правило – не останавливаться; и повсеместный мусор, контрастирующий с пышной тропической зеленью…

Отдельным и непростым испытанием стал местный климат: вечная духота и влажность снаружи и ледяной воздух от кондиционеров внутри привели к тому, что простуда стала почти неизбежным спутником всех участников поездки.

В итоге командировка получилась исключительно продуктивной. Мы не только выполнили все поставленные научные задачи, но и укрепили личные и профессиональные связи с нашими вьетнамскими коллегами, что, без сомнения, поможет в нашей дальнейшей совместной работе.

Перспективы Российско-Вьетнамского сотрудничества

Экологический проект «Разработка биопрепаратов для фитобиоремедации почв, загрязненных диоксинами» выполняется лабораторией МГММ ФИЦ КазНЦ РАН и лабораторией микробиологии отдела биотехнологий Вьетнамской части совместного Российско-Вьетнамского Тропического центра в городе Ханой. Проект предполагает регулярные визиты сотрудников партнерских групп в города Ханой и Казань для проведения совместных экспериментов.

С блестящей защитой, Родерик!

Кандидатская диссертация –
научно-квалификационный труд, позволяющий
соискателю продемонстрировать имеющиеся
теоретические навыки, а также собственный интеллектуальный
уровень в выбранной отрасли исследований.

 

23 октября 2025 года стал знаменательным днем для лаборатории МГММ!

На заседании Диссертационного совета КФУ.015.5 ФГАОУ ВО «Казанский (Приволжский) федеральный университет» состоялась защита диссертации Диабанкана Родерик Жиль Кларе на тему «Сравнительный анализ биологических свойств морфотипов эндофитного штамма Bacillus mojavensis PS17», представленную на соискание ученой степени кандидата биологических наук по специальности 1.5.11. Микробиология.

Самостоятельное и оригинальное исследование нашего коллеги посвящено сравнительной оценке биологических свойств морфотипов эндофитной бактерии B. mojavensis PS17 для определения перспектив применения в качестве биологического агента. Впервые изучены механизмы диссоциации бактериального агента биоконтроля B. mojavensis PS17 и их влияние на биоконтрольные свойства. Получены новые данные о межвидовом распространении штамма и его способности к вертикальному переносу.

Защита прошла в доброжелательной атмосфере. Диссертант блестяще представил доклад и уверенно ответил на все вопросы членов Диссертационного совета.

Мы гордимся тобой, дорогой Родерик, и желаем новых творческих свершений!

5-й Российский Микробиологический Конгресс в городе-герое Волгограде

В городе-герое Волгограде с 29 сентября по 03 октября 2025 года на базе Волгоградского государственного медицинского университета (ВолгГМУ) успешно прошел 5-й Российский микробиологический конгресс. Организаторами выступили Российское микробиологическое общество совместно с ведущими университетами и научными институтами страны. Конгресс стал важной площадкой для обмена опытом, обсуждения актуальных проблем микробиологии и укрепления научных связей.

Организационный комитет был представлен ведущими специалистами в области микробиологи: председатель – ректор ВолгГМУ, д.м.н., профессор В.В. Шкарин, а также проректоры ВолгГМУ, ученые из МГУ, ФИЦ Биотехнологии РАН, представители кафедры микробиологии ВолгГМУ и других научных центров России.

Конгресс предполагал как пленарные, секционные и стендовые доклады, постерные сессии, так и участие в качестве слушателей.

Цели и задачи Конгресса:

  • оценка современного состояния микробиологической науки в Российской Федерации и ее позиций на международной арене;
  • выявление перспективных направлений фундаментальных и прикладных исследований;
  • установление прямых контактов между учеными, образовательными учреждениями и бизнесом.

Основные направления конгресса:

1) разнообразие и экология микроорганизмов;
2) метаболизм и геномика микроорганизмов;
3) микробные технологии;
4) медицинская микробиология.

Дополнительные секции:

— молекулярная биология, биохимия и экология дрожжей;
— бактериофаги и другие вирусы микроорганизмов.

В рамках проведения 5-го Российского микробиологического конгресса также прошел 7-й Съезд Межрегионального микробиологического общества (ММО), а также встреча с редколлегией журнала «Микробиология».

В работе Конгресса приняли участие сотрудники лаборатории МГММ ФИЦ КазНЦ РАН Ш.З. Валидов, Н.В. Трахтман, Э.Р. Сулейманова и Е.А. Клочкова.

Доклад наших коллег был представлен на постерной сессии и опубликован в сборнике тезисов 5-го Российского микробиологического конгресса.


Э.Р. Сулейманова и Е.А. Клочкова у постера

Во время Конгресса были обсуждены задачи коллективов лаборатории МГММ (ФИЦ КазНЦ РАН) и лаборатории Микробиологической трансформации органических соединений (ФИЦ ПНЦБИ РАН) в рамках проекта «Генетические технологии для промышленной микробиологии и зеленой химии: экспрессионные платформы, продуценты ферментов и промышленно важных соединений» (Соглашение №075-15-2025-471 от 29.05.2025 г.

Культурная программа состояла из обзорной экскурсии «Город-герой Волгоград» с посещением Мамаева кургана, фуршета и банкета. Участникам Конгресса была предоставлена возможность самостоятельного посещения музея-панорамы «Сталинградская битва».

ВПЕЧАТЛЕНИЯ УЧАСТНИКОВ

Ш.З. Валидов о Конгрессе

Данный конгресс является ключевым событием в жизни Российского микробиологического общества, на котором ученые – микробиологи представляют свои результаты, получают представление о развитии микробиологии и налаживают контакты по взаимодействию коллективов. Возрождению традиции регулярных конгрессов общества мы обязаны нескольким активистам микробиологической науки России: Елизавете Александровне Бонч-Осмоловской (МГУ), Николаю Викторовичу Пименову (ФИЦ «Биотехнологии»), Светлане Николаевне Дедыш (ФИЦ «Биотехнологии»), которые в 2016 г. вместе с коллегами провели первый конгресс в г. Пущино, после чего регулярно организовывали его в разных городах России. Численность участников конгресса выросла со 100 участников на первом до 400 человек на 5-ом Российском микробиологическом конгрессе.

В докладе Елизаветы Александровны о функционировании Межрегионального микробиологического общества было отмечено, что общество объединяет более 600 членов, при этом наш Поволжский регион представлен только 11 участниками. Наши коллеги могли бы пополнить ряды ММО, что является посильным вкладом в развитие организации.

Э.Р. Сулейманова

5-й Российский микробиологический конгресс в городе-герое Волгограде стал вторым мероприятием, на котором мне удалось побывать с постерным докладом. Я люблю такой формат – это и дискуссия, и обмен опытом, и общение, и налаживание контактов с учеными со всей страны. Было очень полезно получить обратную связь на свои результаты и услышать идеи для их улучшения.

Организаторы проделали огромную работу, каждая секция работала как часы, любые вопросы решались мгновенно. Устные доклады были так филигранно отобраны, что иногда хотелось иметь маховик времени, чтобы находиться на всех секциях одновременно.

Очень здорово, что для участников была организована уникальная обзорная экскурсия по великому Городу и на мемориальный комплекс «Родина-мать зовет»!

Солнечный Волгоград оставил самые лучшие впечатления!


Участники конгресса (слева направо)
Е.А. Клочкова, Э.Р. Сулейманова, Н.В. Трахтман, Е.В. Спирина, Ш.З. Валидов.

Н.В. Трахтман о великом Городе на Волге

Приезд в Волгоград – это погружение в уникальный симбиоз прошлого и настоящего. Город, который был стерт с лица земли в 1942-1943 годах, но не был побежден, сегодня предстает перед тобой живым, динамичным, полным сил, но при этом пронизанным памятью о Великой Отечественной войне. Этот контраст между современными широкими проспектами, зелеными парками и монументальными мемориалами, напоминающими о Великой войне, поражает с первых минут. Волгоград – не просто город, это символ стойкости и возрождения. Здесь каждый камень, каждое здание, каждый памятник является историей. Именно это делает его особенным: ты не просто гость, ты часть этой истории, пусть и на короткое время.

Невозможно говорить о Волгограде и не восхититься Мамаевым курганом – местом, которое становится центральной точкой любого визита. Подъем по ступеням к монументу «Родина-Мать зовет!» – это паломничество. Каждый шаг здесь наполнен смыслом, каждый метр земли пропитан кровью и мужеством Советских солдат. Мемориальный комплекс поражает своим масштабом и глубиной символизма: от стен – руин, напоминающих разрушенные здания Сталинграда, до Зала Воинской славы с вечным огнем и именами павших. В Зале Воинской славы понимаешь, что память – это живая связь между поколениями. Стоя на вершине кургана и глядя на Волгу, осознаешь, что именно здесь, на этом клочке земли, решалась судьба не только города, нашей великой страны, а всего мира. Это место не может оставить равнодушным…

Город не скрывает свои шрамы. Мельница Герхардта и некоторые руины оставлены в разрушенном состоянии специально, чтобы люди помнили. Это не музей под открытым небом, а живая память, вписанная в городскую ткань.

Волга в Волгограде спокойна и величественна. Она как будто говорит: несмотря ни на что, жизнь продолжается. И это очень символично для города, который пережил ад войны и возродился. Жители Волгограда – особенные люди! Они гордятся своей историей, помнят прошлое, активно живут в настоящем. Волгоградцы открыты, дружелюбны и готовы рассказать о своем городе, они бережно хранят память и российский код Стойкости, Мужества и Героизма.

Нам очень повезло – экскурсоводом была Ирина Наровна Ермолаева, человек, для которого Сталинградская битва – это личная история, история семьи.

Честно говоря, после посещения города, пообщавшись с местными жителями этот город хочется называть не иначе как Сталинград. Действительно в мире есть множество мест, названных в честь Сталинграда, включая станции метро, площади и улицы: В Париже – станция метро «Сталинград», площадь Сталинградской битвы и одноименный бульвар, в Брюсселе – проспект Сталинграда, в Лионе и Милане – бульвар и улица Сталинграда соответственно.


Мельница Гергардта, Волгоград.

Еще больше фотографий доступно в фотоальбоме.

Биоинформатика в МГММ

Учитесь у знатоков: всей жизни не хватит на то,
чтобы прийти ко всему самостоятельно.
Брайан Трейси

Младший научный сотрудник лаборатории молекулярно-генетических и микробиологических методов Низамов Ш.Р. выступил на семинаре с докладом на тему «Биоинформатика в МГММ».

Шамиль Ринатович рассказал, что биоинформатика – наука, являющаяся междисциплинарной областью, которая объединяет биологию, информатику, математику и статистику для анализа больших объемов биологических данных. Она использует вычислительные методы и программы для решения сложных биологических задач, таких как расшифровка геномов, разработка лекарств и персонализированная медицина, путем интерпретации молекулярно-биологических данных.

Особое внимание докладчик уделил своим исследованиям по теме «Особенности экспрессии генов в мышечной системе приматов». Представил как проходит изучение особенностей экспрессии генов и механизмов ее регуляции в скелетных мышцах человека с учетом индивидуальных особенностей доноров и различий между типами мышц для лучшего понимания патологических процессов и определения молекулярных мишеней для разработки методов лечения мышечных заболеваний.

Исследование основано на методе кэп-анализа экспрессии генов (Cage analysis of gene expression – CAGE), который локализован в России только в НИЛ «Регуляторная геномика» в Казанском федеральном университете. Подготовка CAGE-seq библиотек заключается в выделении тотальной РНК, которые затем захватываются ловушкой для КЭПа и на ее основе синтезируется кДНК, и CAGE тэги считываются с 5’-концов кДНК. Далее идет секвенирование коротких (~ 27 п.н.) CAGE тэгов, после которого при выравнивании последовательности на геном можно определить сайты инициации транскрипции и измерить уровень активности генов (рис. 1).

Рис. 1 – Схема подготовки CAGE библиотек

Участники семинара отметили, что материал представлен докладчиком логично и увлекательно. Присутствующие задавали вопросы, уточняли перспективы и инновации в биоинформатике.

В лаборатории МГММ Низамов Ш.Р. приступил к работе в группе биоинформатики совместно с м.н.с. Сухановым А.Ю. В данный момент их деятельность сосредоточена на исследовании сигнальных пептидов, предсказанных с использованием инструмента SignalP 6.0, в штаммах, составляющих основу коллекции лаборатории МГММ.

Немного об авторе. Низамов Ш.Р. в 2016-2020 гг. закончил кафедру микробиологии ИФМиБ КФУ (бакалавр), в 2020-2022 гг. – кафедру зоологии и общей биологии ИФМиБ КФУ (магистр), в 2022 г. поступил в аспирантуру ИФМиБ КФУ. В рамках стажировки KK DNAFORM (Йокогама, Япония, 2023 г.) Низамовым Ш.Р. освоены методики сверхбыстрого анализа генома на основе серверного программного обеспечения AAS-G1 (в быстром режиме AAS-G1 может анализировать геном человека менее чем за 8 минут), включая подготовку необходимых файлов для анализа, установку и настройку программного обеспечения AAS-G1 и непосредственно анализ данных.