Лабмитинги

Микробиология учит нас, что размер не является
мерой значимости; даже самый маленький микроб
может обладать огромной силой.
Алу Дениш Обиеро

Руководитель лаборатории Ш.З. Валидов на еженедельном семинаре проверил темпы выполнения сотрудниками Государственного задания «Развитие природоподобных агротехнологий для улучшения экологического состояния агроландшафтов и производства безопасной и качественной сельскохозяйственной продукции».

Затем младший научный сотрудник Е.Ю. Шульга выступила с докладом на тему «Создание бактериального консорциума на основе нативных штаммов озимой пшеницы». Елена Юрьевна представила данные по созданию универсального консорциума, состоящего из совместимых между собой нативных изолятов озимой пшеницы, обладающих способностью к стимуляции роста растений и защите от фитопатогенных грибов – Stenotrophomonas rhizophila MGMM118, Bacillus halotolerans MGMM119, Pseudomonas marginalis MGMM120 и Pseudomonas fluorecsens MGMM121.

В процессе исследований изучено влияние бактериального консорциума на культурные растения. В эксперименте по биоконтролю in planta установлена эффективность консорциума по отношению к действию патогенов (Fusarum oxysporum и Alternaria alternata). Консорциум способствует и увеличению биометрических показателей озимой пшеницы.

Таким образом, поэтапная экспресс-диагностика перспективных штаммов позволяет сократить сроки работ по выделению агентов биозащиты растений.

Рисунок 1 – Антагонизм против F. oxysporum (A) и A. alternata (B)

Одна машина может выполнить работу пяти
обыкновенных людей, но ни одной машине не под силу
выполнить работу талантливого человека.
Элберт Хаббард

Александр Владимирович Лайков провел образовательный семинар, посвященный основам масс-спектрометрического анализа и сферам его применения.

А.В. Лайков – научный сотрудник лаборатории МГММ, кандидат биологических наук, специалист в области масс-спектрометрического анализа биологических объектов – неоднократно проходил стажировки в Протеомном центре Научно-исследовательского института физико-химической медицины (ФГБУН НИИ ФХМ ФМБА России, г. Москва); тренинги по работе с масс-спектометрическим оборудованием, организованные компанией Sciex (РФ, г. Казань; Германия, г. Дармштадт).

Во время семинара Александр Владимирович, имеющий большой опыт работы в области протеомного и метаболомного анализа медицинских объектов, бактериальных и клеточных культур, объектов окружающей среды, представил устройство масс-спектрометра, провел обзор основных типов источников ионов, анализаторов и детекторов. Особое внимание он уделил масс-спектрометрам, совместимым с жидкостными хроматографами, позволяющими предварительно разделять сложные смеси соединений. Рассмотрел методы пробоподготовки и анализа образцов, применяемые в метаболомике и протеомике. На примере опубликованных результатов исследований продемонстрировал использование современных технологий для поиска биомаркеров, оценки изменений экспрессии отдельных метаболических путей, а также образования новых продуктов метаболизма при изменении источника питания бактерий.

Сотрудники лаборатории МГММ получили возможность изучить работу ионного источника электроспрей и таких анализаторов как квадрупольные, времяпролетные и гибридные варианты.

Участники семинара отметили важность применения масс-спектрометрии в современных биологических исследованиях, полезность полученных знаний для решения актуальных задач в профессиональной деятельности.

Традицией лаборатории МГММ является еженедельное проведение семинаров. Каждый четверг руководитель лаборатории информирует сотрудников по научным и другим направлениям жизни ФИЦ КазНЦ РАН в целом и деятельности лаборатории в частности. Затем один или несколько научных сотрудников представляют презентации по конкретным этапам выполнения Государственного задания, проекта или гранта.

На недавнем семинаре после выступления руководителя лаборатории Ш.З. Валидова по организационными вопросами был представлен доклад старшего научного сотрудника, к.б.н. Э.В. Бабынина. Тема доклада «Секвенирование и анализ генов плазмид штамма Stutzerimonas stutzeri». В рамках Государственного задания получены результаты нанопорового секвенирования плазмид, выделенных из штамма деструктора углеводородов S. stutzeri. Аннотирование генов, находящихся на одной из плазмид, показало наличие генов, необходимых для межклеточного переноса данной плазмиды.

В дальнейшем планируется определение возможности использования этих плазмид в качестве генетического вектора для различных биотехнологических целей.