Куприянова Елена Андреевна
ОТЧЕТ по научным исследованиям за 1 курс, 2 семестр обучения
|
Направление подготовки |
06.06.01 — Биологические науки |
|
Направленность (специальность) |
03.03.03 — Микробиология |
|
Структурное подразделение ФИЦ КазНЦ РАН, Лаборатория |
Казанский институт биохимии и биофизики ФИЦ КазНЦ РАН, лаборатория «Молекулярных основ патогенеза» |
|
Научный руководитель |
д.б.н. Чернов В.М. |
|
Тема научно-квалификационной работы |
«Кишечная микробиота у детей с функциональными расстройствами: микробный профиль и его модуляция» |
- Выполнение индивидуального плана научных исследований (за соответствующий период)
|
№ п/п |
Запланировано |
Выполнено (% выполнения) |
|
1 |
Получение штамма бактерии L. plantarum, проявляющего повышенную устойчивость к кларитромицину и амоксициллину |
100% |
|
2 |
Получение клинических изолятов штаммов L. plantarum от пациентов до и после антибиотикотерапии |
100%
|
|
3 |
Сравнительный анализ геномов штаммов бактерии. |
100% |
- Краткое описание полученных на текущий момент результатов
В результате селекции исходного лабораторного штамма L. plantarum 8P-A3 был получен штамм L. plantarum 8P-A3 Clr + Amx с высокой устойчивостью как к кларитромицину, так и к амоксициллину (концентрация Clr 5,5 мкг / мл и концентрация Amx 14,5 мкг / мл). Десять мутаций были обнаружены в геноме L. plantarum 8P-A3Clr + Amx, в том числе 4 мутации в генах-мишенях антибиотиков (rplD, rplV, penA, pbpB) и 6 новых мутаций в генах, которые ранее не упоминались в качестве детерминант устойчивости к антибиотикам у бактерий. Однако мутации, выявленные в L. plantarum 8P-A3Clr + Amx, не были обнаружены в геноме клинического изолята L. plantarum HP227-5.
Наши данные свидетельствуют о том, что механизмы адаптации к антимикробным препаратам in vitro и in vivo у бактерии L. plantarum могут значительно различаться.
- Публикации по теме научно-квалификационной работы (за все время обучения, включая тезисы докладов):
|
№ п/п |
Библиографическое описание |
Название издания (отметить издания из перечня ВАК) |
|
1 |
Куприянова Е.А. Определение антибиотикорезистентных форм бактерии H.pylori в образцах биопсии желудка с помощью секвенирования / Е.А. Куприянова, С.Ю. Маланин, Д.Д. Сафина, С.Р. Абдулхаков. – 2018. |
Тезисы докладов 71-й Всероссийской с международным участием школы-конференции молодых ученых «Биосистемы: организация, поведение, управление» |
|
2 |
Kupriyanova E.A. Helicobacter pylori influences the metagenomic profile of human gastric mucosa / E. Kupriyanova, S. Malanin, D. Safina, A. Safin, I. Alieva, A. Ziyatdinov, S.R. Abdulkhakov, R.A. Abdulkhakov, T. Grigoryeva. – 2018. |
26th United European Gastroenterology Week Abstract Issue |
|
3 |
Куприянова Е.А. Метагеномный анализ слизистой оболочки желудка при инфекции Helicobacter pylori. – 2018. |
Сборник тезисов Итоговой научно-образовательной конференции студентов казанского федерального университета |
|
4 |
Куприянова Е.А., Хуснутдинова Д.Р. Микробиота кишечника человека: метагеном при персистенции H. pylori. – 2019. |
Материалы XI Всероссийского конгресса молодых ученых-биологов с международным участием |
|
5 |
Khusnutdinova D. The development of resistance to clarithromycin and amoxicillin in Lactobacillus plantarum is accompanied by mutations not only in target genes / Khusnutdinova D., Markelova M., Boulygina E., Kupriyanova E., Siniagina M., Baranova N., Grigoryeva T., Chernov V., Chernova O. – 2019. |
27th United European Gastroenterology Week Abstract Issue |
- Апробация результатов научно-квалификационной работы (за все время обучения):
|
№ п/п |
Название конференции |
Тип доклада |
|
1 |
71-я Всероссийская с международным участием школа-конференция молодых ученых «Биосистемы: организация, поведение, управление» |
Стендовый |
|
2 |
Итоговая конференция ФИЦ КазНЦ РАН |
Устный |
- Иные достижения аспиранта:
(участие в конкурсах, грантах, полученные премии, дипломы, именные стипендии и т.п. (указать, где получено и за что), стажировки)