ОТЧЕТ по научным исследованиям за 4 курс

ОТЧЕТ по научным исследованиям за 4 курс

  Назипова Алсу Рашидовна ОТЧЕТ по научным исследованиям за 4 курс  

Направление подготовки	06.06.01 -  Биологические науки
Направленность (специальность)	03.01.05 - Физиология и биохимия растений
Структурное подразделение ФИЦ КазНЦ РАН, Лаборатория	Казанский институт биохимии и биофизики ФИЦ КазНЦ РАН, лаборатория механизмов роста растительных клеток
Научный руководитель	Козлова Л.В., к.б.н., с.н.с.
Тема научно-квалификационной работы	Гликозилгидролазы в ходе роста растяжением корней проростков кукурузы (Zea mays L.)

 

1. Выполнение индивидуального плана научных исследований (за соответствующий период)

 

№ п/п	Запланировано	Выполнено (% выполнения)
1	Выявление особенностей локализации фукозилированного и нефукозилированного ксилоглюкана в различных зонах корня кукурузы, как потенциального субстрата для действия фукозидаз, галактозидаз и ксилозидаз.	100%
2	Кластерный анализ экспрессии генов гликозилгидролаз, специфично экспрессирующихся на разных этапах роста растяжением.	100%
3	Характеристика пектинметилэстераз и их ингибиторов, а также их экспрессии ходе роста растяжением корня кукурузы	100%

 

1. Краткое описание полученных на текущий момент результатов

На основе ранее полученных данных транскриптомного анализа был сформирован список генов, кодирующих гликангидролазы. Список генов гликангидролаз был подвергнут кластерному анализу, в результате которого выявились группы с различными профилями экспрессии. Группа генов, демонстрирующая увеличение уровня экспрессии при активном росте и его завершении включала гликангидролазы, действующие на боковые заместители ксилоглюкана и арабиноксилана. С помощью коммерческих антител была оценена локализация фукозилированного и нефукозилированного ксилоглюкана в тканях корня проростка кукурузы. Для злаков, на примере кукурузы, характерен ксилоглюкан, содержащий в боковых цепях ксилозу и галактозу, но не фукозу. Тем не менее, фукозилированный ксилоглюкан был обнаружен в слизи ризодермиса и во флоэме на стадии раннего и активного растяжения корня.  Были идентифицированы гены пектинметилэстераз и их ингибиторов. Оценена динамика их экспрессии и выявлены несколько генов пектинметилэстераз, которые могут осуществлять деметилирование пектинов во время роста растяжением, что согласуется с данными транскриптомики и иммунохимии, полученными ранее.  

1. Публикации по теме научно-квалификационной работы (за все время обучения, включая тезисы докладов):

 

№ п/п	Библиографическое описание	Название издания (отметить издания из перечня ВАК)
1	Козлова Л.В., Мокшина Н.Е., Назипова А.Р., Горшкова Т.А. Системное использование «хромых» ферментов в растительных клеточных стенках // Физиология растений. – 2017. – Т. 64. – №. 6. – С. 418-432.	+
2	Mokshina, N., Makshakova, O., Nazipova, A., Gorshkov, O., & Gorshkova, T. Flax rhamnogalacturonan lyases: phylogeny, differential expression and modeling of protein structure // Physiologia plantarum. – 2018. doi:10.1111/ppl.12880	+
3	Козлова Л.В., Назипова А.Р., Агеева М.В., Горшкова Т.А. Ксиланы растительных клеточных стенок: структура и функции отдельных популяций молекул // Экспериментальная биология растений: фундаментальные и прикладные аспекты: Годичное собрание ОФР, науч. конф. и школа для мол. уч., 18-24 сент. 2017 г., Судак: сб. мат. докл. / Отв. ред. Вл.В. Кузнецов – М: Изд-во АНО «Центр содействия научной, образовательной и просветительской деятельности «Соцветие», 2017.– 197 с. ISBN 978-5-6040052-0-0
4	Назипова А.Р., Мокшина Н.Е., Горшков О.В., Горшкова Т.А. Рамногалактуронанлиазы флоэмных волокон льна-долгунца // Экспериментальная биология растений: фундаментальные и прикладные аспекты: Годичное собрание ОФР, науч. конф. и школа для мол. уч., 18-24 сент. 2017 г., Судак: сб. мат. докл. / Отв. ред. Вл.В. Кузнецов – М: Изд-во АНО «Центр содействия научной, образовательной и просветительской деятельности «Соцветие», 2017. – 242 с. ISBN 978-5-6040052-0-0
5	Козлова Л.В., Назипова А.Р., Агеева М.В., Микшина П.В., Гильмуллина Л.Ф., Пономарев С.Н., Пономарева М.Л., Горшкова Т.А. Арабиноксиланы ржи как селекционно-значимый признак // Фундаментальная гликобиология [Электронный ресурс] : сб. материалов IV Всерос. конф., 23–28 сентября 2018 года. –Киров : Науч. изд-во ВятГУ, 2018. – 17 с. ISBN 978-5-98228-172-2
6	Назипова А.Р., Агеева М.В., Козлова Л.В., Горшкова Т.А. Реорганизация первичных клеточных стенок второго типа в ходе роста растяжением. // Фундаментальная гликобиология [Электронный ресурс] : сб. материалов IV Всерос. конф., 23–28 сентября 2018 года. –Киров : Науч. изд-во ВятГУ, 2018. – 258 с. ISBN 978-5-98228-172-2
	Kozlova L., Petrova A., Gorshkov O., Ageeva M., Nazipova A., Enejskaya E., Kul’minskaya A., Gorshkova T. New players in elongation growth of cereals revealed by transcriptome analysis of maize root // XV Cell Wall Meeting, Cambridge, United Kingdom, 2019. p 226.
	Nazipova. A., Kozlova L., Trofimova O., Ageeva M., Mikshina M., Gilmullina L., Ponomarev S., Ponomareva M., Gorshkova T. GRAIN ARABINOXYLANS AS THE TARGET FOR RYE BREEDING XV Cell Wall Meeting, Cambridge, United Kingdom, 2019. p 200
7	Гордеева Е.П., Назипова А.Р., Микшина П.В.,Горшкова Т.А. Рамногалактуронан I в третичных клеточных стенках волокон различных растений // IX Съезд общества физиологов растений России "Физиология растений – основа создания растений будущего" (Казань, 19-21 сентября 2019 г.): тезисы докладов. – Электрон. текстовые дан. (1 файл 136,67 Мб) – Казань: Издательство Казанского университета, 2019. – 130 с. DOI: 10.26907/978-5-00130-204-9-2019-130
8	Козлова Л.В., Петрова А.А., Горшков О.В., Назипова А.Р., Агеева М.В., Меллерович E., Горсаз A., Горшкова Т.А. Рост растяжением в корне кукурузы: хроника событий // IX Съезд общества физиологов растений России "Физиология растений – основа создания растений будущего" (Казань, 19-21 сентября 2019 г.): тезисы докладов. – Электрон. текстовые дан. (1 файл 136,67 Мб) – Казань: Издательство Казанского университета, 2019. – 218 с. DOI: 10.26907/978-5-00130-204-9-2019-218
9	Назипова А.Р., Козлова Л.В., Горшков О.В., Энейская Е.В., Кульминская А.А., Горшкова Т.А. Инициация роста растяжением в корне кукурузы – взгляд со стороны транскриптомики // IX Съезд общества физиологов растений России "Физиология растений – основа создания растений будущего" (Казань, 19-21 сентября 2019 г.): тезисы докладов. – Электрон. текстовые дан. (1 файл 136,67 Мб) – Казань: Издательство Казанского университета, 2019. – 303 с. doi: 10.26907/978-5-00130-204-9-2019-303
10	Петрова Н.В., Горшков О.В., Назипова А.Р., Горшкова Т.А.Дифференциальная экспрессия лектинов группы Nictaba в растениях льна // IX Съезд общества физиологов растений России "Физиология растений – основа создания растений будущего" (Казань, 19-21 сентября 2019 г.): тезисы докладов. – Электрон. текстовые дан. (1 файл 136,67 Мб) – Казань: Издательство Казанского университета, 2019. – 346 с. DOI: 10.26907/978-5-00130-204-9-2019-346
11	Л.В. Козлова, А.Р. Назипова, О.В. Горшков, М.В. Агеева, Е.В. Энейская, А.А. Кульминская, Т.А. Горшкова Участие ферментов углеводного метаболизма в росте растяжением клеток корня кукурузы // НАУЧНЫЕ ТРУДЫ. Том 2. – М.: Издательство «Перо», 2019. – с.272 ISBN 978-5-00150-521-1
12	А.Р. Назипова, Л.В. Козлова, Н.Н. Ибрагимова, Е.В. Энейская, А.А Кульминская, Т.А. Горшкова Изменения полисахаридов клеточных стенок, сопровождающие рост растяжением мезокотилей кукурузы // НАУЧНЫЕ ТРУДЫ. Том 2. – М.: Издательство «Перо», 2019. – с.299 ISBN 978-5-00150-521-1
13	Liudmila Kozlova Alsu R. Nazipova, Oleg V. Gorshkov, Anna A. Petrova & Tatyana A. Gorshkova Elongating maize root: zone-specific combinations of polysaccharides from type I and type II primary cell walls //Scientific reports. – 2020. – Т. 10. – №. 1. – С. 1-20.	+
14	Anna Petrova, Liudmila Kozlova, Oleg Gorshkov, Alsu Nazipova, Marina Ageeva, Tatyana Gorshkova. Сell wall layer induced in xylem fibers of flax upon gravistimulation is similar to constitutively formed cell walls of bast fibers // Frontiers in Plant Science, accepted to publication.
15	Natalia Petrova, Alsu Nazipova, Oleg Gorshkov, Natalia Mokshina, Olga Patova, Tatyana Gorshkova. Gene Expression Patterns for Proteins with Lectin Domains in Flax Stem Tissues are Related to Deposition of Distinct Cell Wall Types // Frontiers in Plant Science, accepted to publication.

 

1. Апробация результатов научно-квалификационной работы (за все время обучения):

 

№ п/п	Название конференции	Тип доклада
1	Козлова Л.В., Назипова А.Р., Агеева М.В., Горшкова Т.А. Ксиланы растительных клеточных стенок: структура и функции отдельных популяций молекул // Годичное собрание Общества физиологов растений России. Крым, Судак 2017. С 197.	стендовый доклад
2	Назипова А.Р., Мокшина Н.Е., Горшков О.В., Горшкова Т.А. Рамногалактуронанлиазы флоэмных волокон льна-долгунца // Годичное собрание Общества физиологов растений России. Крым, Судак 2017. С 242.	стендовый доклад
3	Назипова А.Р. Глюкуроноарабиноксилан в ходе роста растяжением мезокотилей проростков кукурузы // Итоговая научная конференция ФИЦ КазНЦ РАН. Казань, 2018.	устный доклад
4	Назипова А.Р., Агеева М.В., Козлова Л.В., Горшкова Т.А. Реорганизация первичных клеточных стенок второго типа в ходе роста растяжением. // IV Всероссийская конференция Фундаментальная гликобиология. Киров, 2018. С. 100-101.	устный доклад
5	Назипова А.Р., Козлова Л.В., Горшков О.В., Горшкова Т.А. Гены, вовлеченные в инициацию роста растяжением в корне кукурузы // Итоговая научная конференция ФИЦ КазНЦ РАН. Казань, 2019.	устный доклад
6	Kozlova L.V., Petrova A.A., Gorshkov O.V., Ageeva M.V., Nazipova A.R., Enejskaya E.V., Kul’minskaya A.A., Gorshkova T.A. New players in elongation growth of cereals revealed by transcriptome analysis of maize root // XV Cell Wall Meeting, Cambridge, United Kingdom, 2019. p 226.	стендовый доклад
7	Назипова А.Р., Козлова Л.В., Горшков О.В., Энейская Е.В., Кульминская А.А., Горшкова Т.А. Инициация роста растяжением в корне кукурузы - взгляд со стороны транскриптомики // IX Съезд физиологов растений России, Казань, 2019. С 303.	стендовый доклад+флеш-презентация
8	А.Р. Назипова, Л.В. Козлова, Н.Н. Ибрагимова, Е.В. Энейская, А.А Кульминская, Т.А. Горшкова Изменения полисахаридов клеточных стенок, сопровождающие рост растяжением мезокотилей кукурузы // VI Съезд биохимиков России, Сочи-Дагомыс, 2019. С 280.	стендовый доклад
9	А.Р. Назипова, Рост растяжением: так ли сильно отличается этот процесс у однодольных и двудольных растений? Итоговая научная конференция ФИЦ КазНЦ РАН. Казань, 2020	устный доклад
10	А.Р. Назипова Гликозил-гидролазы в ходе роста растяжением корня кукурузы. Итоговая научная конференция ФИЦ КазНЦ РАН. Казань, 2021

 

1. Иные достижения аспиранта:

Повышение квалификации в ФГБОУ ВС "ВятГУ" по дополнительной профессиональной программе "Современные достижения в исследовании строения, свойств и биологических функций сложных углеводов" (удостоверение 050000000132, р/н ДПО 1795, г. Киров, дата выдачи: 27.09.2018)   Исполнитель в грантах: Грант РНФ №16-14-10256, руководитель Горшкова Т.А. (2016-2018)  Грант президента РФ для государственной поддержки молодых российских ученых МК 2584.2017.4 руководитель Козлова Л.В (2017-2019). Грант РФФИ №17-29-08023 офи_м, руководитель Горшкова Т.А. (2017-настоящее время). Грант РНФ №18-14-00168, руководитель Козлова Л.В. (2018-настоящее время) Грант РНФ №19-14-00361, руководитель Горшкова Т.А. (2019-настоящее время).   Участник Школы молодых ученых "IT-технологии в физиологии растений" в рамках IX Съезда физиологов растений России, Казань, 18-24 сентября 2019.    Лауреат конкурса молодых ученых за доклад "Изменения полисахаридов клеточных стенок, сопровождающие рост растяжением мезокотилей кукурузы" соавторы: Л.В. Козлова, Н.Н. Ибрагимова, Е.В. Энейская, А.А Кульминская, Т.А. Горшкова в спекции "Гликобиология" VI Съезда биохимиков России, Сочи-Дагомыс, 1-6 октября 2019   Победитель конкурса «Лучший молодой ученый (аспирант) ФИЦ КазНЦ РАН 2019» в номинации «Лучший аспирант в области биологических и сельскохозяйственных наук»   Подпись аспиранта   Подпись научного руководителя